Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ULK3Q6PHR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ULK3Q6PHR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms