Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASC4Q6P4E1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASC4Q6P4E1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms