Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT80Q6KB66 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT80Q6KB66 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT80Q6KB66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms