Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCTP1Q6DN14 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCTP1Q6DN14 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCTP1Q6DN14 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms