Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC19Q6DKK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC19Q6DKK2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms