Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG16L1Q676U5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG16L1Q676U5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms