Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC38Q5VT99 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC38Q5VT99 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC38Q5VT99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms