Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM164Q5U3C3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM164Q5U3C3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms