Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES3Q5TGS1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HES3Q5TGS1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HES3Q5TGS1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms