Protein–RNA interactions for Protein: Q5RI15

COX20, Cytochrome c oxidase protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX20Q5RI15 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX20Q5RI15 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COX20Q5RI15 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX20Q5RI15 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms