Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCID2Q5JVF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCID2Q5JVF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCID2Q5JVF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms