Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNT1Q5JUK3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNT1Q5JUK3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms