Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFDP3Q5H9I0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFDP3Q5H9I0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFDP3Q5H9I0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFDP3Q5H9I0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms