Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB6CQ53S08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB6CQ53S08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms