Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAT3Q53EU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAT3Q53EU6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms