Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms