Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FNDC1Q4ZHG4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FNDC1Q4ZHG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FNDC1Q4ZHG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms