Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GREB1Q4ZG55 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GREB1Q4ZG55 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GREB1Q4ZG55 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GREB1Q4ZG55 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms