Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN20Q4JDL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN20Q4JDL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms