Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO43Q4G163 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO43Q4G163 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms