Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDNFQ49AH0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDNFQ49AH0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDNFQ49AH0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms