Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2CQ496J9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SV2CQ496J9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms