Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HFEQ30201 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HFEQ30201 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HFEQ30201 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HFEQ30201 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HFEQ30201 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HFEQ30201 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HFEQ30201 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HFEQ30201 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HFEQ30201 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HFEQ30201 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HFEQ30201 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HFEQ30201 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HFEQ30201 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HFEQ30201 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HFEQ30201 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HFEQ30201 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HFEQ30201 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HFEQ30201 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HFEQ30201 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HFEQ30201 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HFEQ30201 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HFEQ30201 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HFEQ30201 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HFEQ30201 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HFEQ30201 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HFEQ30201 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HFEQ30201 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HFEQ30201 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HFEQ30201 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HFEQ30201 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HFEQ30201 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HFEQ30201 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HFEQ30201 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms