Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRED3Q2MJR0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRED3Q2MJR0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms