Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LONRF2Q1L5Z9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF2Q1L5Z9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF2Q1L5Z9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF2Q1L5Z9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF2Q1L5Z9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF2Q1L5Z9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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