Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMPG1Q17R60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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