Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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