Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPE65Q16518 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPE65Q16518 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPE65Q16518 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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