Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNXAQ16473 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms