Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZFHX3Q15911 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZFHX3Q15911 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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