Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1Q15904 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6AP1Q15904 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP6AP1Q15904 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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