Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAD1Q15797 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD1Q15797 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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