Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGN3Q15651 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGN3Q15651 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms