Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS2Q15018 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS2Q15018 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABRAXAS2Q15018 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms