Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCAPHQ15003 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPHQ15003 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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