Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CAPRIN1Q14444 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPRIN1Q14444 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPRIN1Q14444 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPRIN1Q14444 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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