Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1DQ13901 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1DQ13901 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1DQ13901 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1DQ13901 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1DQ13901 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1DQ13901 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1DQ13901 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1DQ13901 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1DQ13901 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1DQ13901 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1DQ13901 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1DQ13901 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1DQ13901 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1DQ13901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1DQ13901 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1DQ13901 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1DQ13901 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1DQ13901 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1DQ13901 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1DQ13901 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1DQ13901 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1DQ13901 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1DQ13901 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1DQ13901 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1DQ13901 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1DQ13901 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1DQ13901 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1DQ13901 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1DQ13901 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1DQ13901 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1DQ13901 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1DQ13901 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1DQ13901 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1DQ13901 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1DQ13901 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1DQ13901 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1DQ13901 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1DQ13901 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1DQ13901 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1DQ13901 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1DQ13901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1DQ13901 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms