Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA9Q13797 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA9Q13797 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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