Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRR1Q13601 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRR1Q13601 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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