Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRQ13535 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRQ13535 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRQ13535 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRQ13535 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRQ13535 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRQ13535 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRQ13535 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRQ13535 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRQ13535 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRQ13535 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRQ13535 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRQ13535 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRQ13535 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRQ13535 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRQ13535 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRQ13535 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRQ13535 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATRQ13535 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRQ13535 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRQ13535 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATRQ13535 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATRQ13535 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRQ13535 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRQ13535 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATRQ13535 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATRQ13535 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRQ13535 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRQ13535 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRQ13535 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRQ13535 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRQ13535 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRQ13535 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRQ13535 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRQ13535 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRQ13535 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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