Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGDRQ13258 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGDRQ13258 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTGDRQ13258 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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