Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF1Q13077 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF1Q13077 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAF1Q13077 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF1Q13077 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF1Q13077 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF1Q13077 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF1Q13077 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF1Q13077 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAF1Q13077 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF1Q13077 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF1Q13077 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF1Q13077 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF1Q13077 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF1Q13077 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF1Q13077 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF1Q13077 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF1Q13077 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRAF1Q13077 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRAF1Q13077 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF1Q13077 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms