Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECH1Q13011 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECH1Q13011 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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