Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACSM1Q08AH1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACSM1Q08AH1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM1Q08AH1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms