Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SRSF4Q08170 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms