Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 PHF19-211ENST00000474402 578 ntTSL 411.07□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 PHF19-206ENST00000453868 565 ntTSL 59.47□□□□□ -0.895e-6■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 PHF19-209ENST00000464712 553 ntTSL 45.84□□□□□ -1.475e-6■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.042e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.22e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.282e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.432e-7■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 C9orf78-204ENST00000461762 2390 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-12■■■■□ 23.7
SRSF1Q07955 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.533e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.773e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-203ENST00000468069 784 ntTSL 35.75□□□□□ -1.493e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.13□□□□□ -1.913e-10■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 23.6
SRSF1Q07955 NCBP3-203ENST00000574379 918 ntTSL 210.53□□□□□ -0.723e-9■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 NCBP3-204ENST00000574911 2701 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.323e-9■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 NCBP3-205ENST00000575815 4096 ntTSL 26.55□□□□□ -1.363e-9■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.363e-9■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.141e-8■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 216.11■□□□□ 0.171e-8■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.421e-8■■■■□ 23.5
SRSF1Q07955 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-10■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.149e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.069e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 EGFL8-221ENST00000432129 825 ntTSL 519.23■□□□□ 0.679e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 PPT2-EGFL8-201ENST00000421600 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.34■□□□□ 0.219e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 EGFL8-223ENST00000482938 533 ntTSL 315.98■□□□□ 0.159e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 PPT2-EGFL8-206ENST00000583227 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.46■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 PPT2-EGFL8-203ENST00000428388 2878 ntAPPRIS P5 TSL 212.59□□□□□ -0.399e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 EGFL8-222ENST00000466239 2441 ntTSL 212.09□□□□□ -0.479e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.759e-8■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 MAN2C1-236ENST00000567360 457 ntTSL 218.4■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 23.4
SRSF1Q07955 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.982e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 ANKRD28-203ENST00000439830 592 ntTSL 524.23■■□□□ 1.472e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLBP-203ENST00000480936 558 ntTSL 422.81■■□□□ 1.242e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 RAC3-202ENST00000580965 831 ntTSL 219.33■□□□□ 0.682e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLBP-204ENST00000483348 1030 ntTSL 315.12■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 RAC3-203ENST00000584341 730 ntTSL 513.49□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLC25A28-203ENST00000479722 581 ntTSL 213.25□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLC25A28-202ENST00000434701 1005 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 CCDC142-208ENST00000486335 566 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 SLC25A28-204ENST00000496035 744 ntTSL 38.25□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 23.68□□□□□ -1.822e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-11■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 WDR73-206ENST00000558608 2154 ntTSL 211.35□□□□□ -0.598e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 WDR73-218ENST00000560966 5071 ntTSL 210.67□□□□□ -0.78e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 MKNK2-203ENST00000585667 870 ntTSL 521.32■■□□□ 12e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 HMGCS1-206ENST00000511774 500 ntTSL 419.67■□□□□ 0.742e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 217.42■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 GGT7-204ENST00000470952 427 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 GGT7-203ENST00000469018 1064 ntTSL 513.91□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 LEPR-206ENST00000462765 2117 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.742e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 MEIOB-207ENST00000496541 807 ntTSL 523.73■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 FAM173A-203ENST00000564640 908 ntTSL 222.31■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 FAM173A-204ENST00000566437 800 ntTSL 322.09■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.034e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 FAM173A-205ENST00000566525 1686 ntTSL 221.29■■□□□ 12e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 320.08■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 RNPS1-218ENST00000566180 814 ntTSL 519.99■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.744e-7■■■■□ 23.2
SRSF1Q07955 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.2
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 168.2 ms