Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFF3Q07654 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFF3Q07654 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms