Protein–RNA interactions for Protein: Q07283

TCHH, Trichohyalin, humanhuman

Predictions only

Length 1,943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHHQ07283 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCHHQ07283 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCHHQ07283 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCHHQ07283 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms