Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL18Q07020 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL18Q07020 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL18Q07020 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms