Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EN1Q05925 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EN1Q05925 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
EN1Q05925 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
EN1Q05925 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
EN1Q05925 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
EN1Q05925 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EN1Q05925 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EN1Q05925 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
EN1Q05925 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EN1Q05925 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EN1Q05925 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EN1Q05925 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EN1Q05925 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EN1Q05925 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EN1Q05925 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
EN1Q05925 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EN1Q05925 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EN1Q05925 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EN1Q05925 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EN1Q05925 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EN1Q05925 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EN1Q05925 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EN1Q05925 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EN1Q05925 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EN1Q05925 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EN1Q05925 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EN1Q05925 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EN1Q05925 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EN1Q05925 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EN1Q05925 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EN1Q05925 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EN1Q05925 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EN1Q05925 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EN1Q05925 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EN1Q05925 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EN1Q05925 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EN1Q05925 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
EN1Q05925 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EN1Q05925 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EN1Q05925 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EN1Q05925 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
EN1Q05925 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EN1Q05925 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EN1Q05925 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EN1Q05925 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EN1Q05925 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EN1Q05925 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EN1Q05925 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
EN1Q05925 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EN1Q05925 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EN1Q05925 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EN1Q05925 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EN1Q05925 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EN1Q05925 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
EN1Q05925 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EN1Q05925 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EN1Q05925 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EN1Q05925 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EN1Q05925 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
EN1Q05925 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EN1Q05925 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EN1Q05925 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EN1Q05925 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EN1Q05925 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EN1Q05925 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms